RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID3AQ99856 593 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 CHGBP05060 677 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K11Q16584 847 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA32Q96LK8 384 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 GLI3P10071 1580 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP7D2Q96T17 732 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 DACT1Q9NYF0 836 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ELP1O95163 1332 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TFCP2Q12800 502 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 COL15A1P39059 1388 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 JAK2O60674 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TYRO3Q06418 890 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TNMDQ9H2S6 317 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNI3KQ59H18 835 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL34Q8N239 644 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TSC1Q92574 1164 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf37Q96NL8 207 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 LUZP1Q86V48 1076 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND15Q9H091 742 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 JCADQ9P266 1359 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5JP18859 108 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 COPRSQ9NQ92 184 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TOM1O60784 492 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK1Q96PY6 1258 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC5O00471 708 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT32Q14532 448 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZUG5 572 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX11Q96FC9 970 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG3Q9NT62 314 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF3C6Q969F1 213 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 BRF1Q92994 677 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM182BQ5T319 152 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 BICD2Q8TD16 824 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF609O15014 1411 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 NR1I2O75469 434 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP21A2P08686 494 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 PGBD1Q96JS3 809 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 CBX8Q9HC52 389 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGB4P16144 1822 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WZG4 1122 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BQV1 296 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 IFFO2Q5TF58 517 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNQ4P56696 695 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FGD1P98174 961 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM177BA6PVY3 158 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 TPM3P06753 285 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGS1P23219 599 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FOSBP53539 338 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 RESTQ13127 1097 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1507.4 ms