RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 NBPF4Q96M43 638 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 PIF1Q9H611 641 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 SASH3O75995 380 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCINQ13939 588 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 SV2BQ7L1I2 683 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 PGBD3Q8N328 593 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM74Q96NL1 305 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBX22Q9Y458 520 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD62A6NC57 917 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCARF1Q14162 830 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 GSX2Q9BZM3 304 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 RUBCNLQ9H714 662 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFCC1Q9HA90 598 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFSO43281 561 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMP20O60882 483 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM157BP0CG42 384 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FCGRTP55899 365 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFHC2Q5JST6 749 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SDE2Q6IQ49 451 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKL1Q969V6 931 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCF12Q99081 682 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPAMQ9HCL2 828 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCB6Q9NP58 842 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIF4AO95239 1232 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOX18P35713 384 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAMC2Q13753 1193 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFE2L2Q16236 605 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCNJLQ8IV13 435 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP44Q9C0F1 390 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GREM1O60565 184 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAP3K6O95382 1288 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 RARAP10276 462 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOX9P48436 509 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERINC3Q13530 473 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHOVQ96L33 236 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 AVPP01185 164 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GARTP22102 1010 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITPKAP23677 461 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 HYAL2Q12891 473 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHC3Q8NDX5 983 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GINM1Q9NU53 330 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFATQ9P243 1243 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms