RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SPAG5Q96R06 1193 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CNGA4Q8IV77 575 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 AK9Q5TCS8 1911 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 IFT74Q96LB3 600 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC42Q96M95 316 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PRC1O43663 620 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 MAP3K9P80192 1104 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ATP2A1O14983 1001 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SETDB1Q15047 1291 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 KRT13P13646 458 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CLGNO14967 610 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 AFMP43652 599 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 NECAB1Q8N987 351 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SLC5A1P13866 664 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 STMN2Q93045 179 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 MYD88Q99836 296 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 STARD3NLO95772 234 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 INPP5BP32019 993 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 FERMT2Q96AC1 680 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 BICDL2A1A5D9 508 aa9.97□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.97□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5DP30049 168 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 BRF1Q92994 677 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CHMP4BP1P59074 171 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SPTLC2O15270 562 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 GBP1P32455 592 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TNNC1P63316 161 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PDE1AP54750 535 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ELF2Q15723 593 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TRIM7Q9C029 511 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 HAND2P61296 217 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ALG1Q9BT22 464 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 KRT23Q9C075 422 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRT-204ENST00000373190 MAPKBP1O60336 1514 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 ZBTB43O43298 467 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 IFT81Q8WYA0 676 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 PCK1P35558 622 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRT-204ENST00000373190 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.95□□□□□ -0.82
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