RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALAS2P22557 587 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMPD1P23109 780 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX18P35713 384 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP5P45974 858 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRLP54845 237 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLAURQ03405 335 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13H1Q8NG92 308 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM129BQ96TA1 746 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRDQ9H2X0 955 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 J3QW42 95 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF21O75509 655 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALBP02768 609 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPB1P15086 417 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 DGKGP49619 791 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 EHHADHQ08426 723 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC16Q8NEE8 873 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R082 166 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR182O15218 404 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIK1P57059 783 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCSK7Q16549 785 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PERM1Q5SV97 790 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 KANK3Q6NY19 840 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMC7Q7Z402 723 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM35AQ86V20 835 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT8Q8WV74 236 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 CITED4Q96RK1 184 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRAGCQ9HB90 399 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 EREGO14944 169 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF4AO95239 1232 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 CES1P23141 567 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPK1P28482 360 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 HYAL2Q12891 473 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE3BQ13370 1112 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 SALL4Q9UJQ4 1053 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHACTR2O75167 634 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACPPP15309 386 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ORC1Q13415 861 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIK5Q16478 980 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMC1Q8TDI8 760 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLD4Q96BZ4 506 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 LILRB5O75023 590 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 GHRHP01286 108 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 NID1P14543 1247 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP11AP98196 1134 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSC3Q14574 896 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 USPL1Q5W0Q7 1092 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 PODNQ7Z5L7 613 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCAPG2Q86XI2 1143 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP120Q8N960 986 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 PMEPA1Q969W9 287 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM11Q96F44 468 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 TREHO43280 583 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC9Q92623 222 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms