RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 CTSWP56202 376 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 SLC51AQ86UW1 340 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 ARID3AQ99856 593 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 CSF1RP07333 972 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 KCNJ4P48050 445 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 TERF1P54274 439 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 METTL24Q5JXM2 366 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 RAD50Q92878 1312 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0G2JLW4 131 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 ATP5JP18859 108 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA4P34932 840 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 GORABQ5T7V8 394 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 COL15A1P39059 1388 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 SSFA2P28290 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 XAGE2Q96GT9 111 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 GNPATO15228 680 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 NUP98P52948 1817 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 ST18O60284 1047 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PDE4D-204ENST00000358923 MCCP23508 829 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 DDIT3P35638 169 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 VPS53Q5VIR6 699 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 TMX3Q96JJ7 454 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 HAUS7Q99871 368 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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PDE4D-204ENST00000358923 ERFEQ4G0M1 354 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PDE4D-204ENST00000358923 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.43■■□□□ 1.02
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PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF609O15014 1411 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ZAP70P43403 619 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 LARGE1O95461 756 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 NTSR2O95665 410 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 ATP2B3Q16720 1220 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 DMTNQ08495 405 aa21.39■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.39■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 COL4A1P02462 1669 aa21.39■■□□□ 1.02
PDE4D-204ENST00000358923 AK2P54819 239 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 CIAO1O76071 339 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM37O94972 964 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 PHKA1P46020 1223 aa21.39■■□□□ 1.01
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PDE4D-204ENST00000358923 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TAF1P21675 1872 aa21.38■■□□□ 1.01
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PDE4D-204ENST00000358923 MCAMP43121 646 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 SLC27A2O14975 620 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 UQCRHP07919 91 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 MAP4K1Q92918 833 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 PPFIA3O75145 1194 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 RUFY3Q7L099 469 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4D-204ENST00000358923 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.36■■□□□ 1.01
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