RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ATP5JP18859 108 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CCZ1BP86790 482 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 FGD1P98174 961 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.5■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 PFKFB2O60825 505 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CYP21A2P08686 494 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ATL3Q6DD88 541 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ERO1AQ96HE7 468 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 TAF3Q5VWG9 929 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 KRT222Q8N1A0 295 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 KCND1Q9NSA2 647 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 NFAT5O94916 1531 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 IGKV5-2P06315 115 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 GSDMDP57764 484 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF609O15014 1411 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 USP28Q96RU2 1077 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 PXDNQ92626 1479 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC25-201ENST00000339007 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SLFN14P0C7P3 912 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 ME1P48163 572 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FOSBP53539 338 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 TNNI3KQ59H18 835 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FSIP1Q8NA03 581 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 COPRSQ9NQ92 184 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 A0A087WWV3 80 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 CTDNEP1O95476 244 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 PDIA6Q15084 440 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 ELF2Q15723 593 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.44■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 GCKRQ14397 625 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 KCNA6P17658 529 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 TERF2Q15554 542 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 TFCP2Q12800 502 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 CHGBP05060 677 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 APOBRQ0VD83 1088 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 NBPF11Q86T75 865 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 HAUS7Q99871 368 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SDF4Q9BRK5 362 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 ERBB3P21860 1342 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms