RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 SLC39A6Q13433 755 aa29.73■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.73■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.73■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 CDC25BP30305 580 aa29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 USP28Q96RU2 1077 aa29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 SKILP12757 684 aa29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 GUCY1B3Q02153 619 aa29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 SYCP1Q15431 976 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 CCT2P78371 535 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 SARM1Q6SZW1 724 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 CFAP45Q9UL16 551 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 NFAT5O94916 1531 aa29.71■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SENP3-201ENST00000321337 CCDC69A6NI79 296 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 CCZ1BP86790 482 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 APOBRQ0VD83 1088 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 MYD88Q99836 296 aa29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 KRT32Q14532 448 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 STX1AQ16623 288 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 FGD1P98174 961 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 NYAP1Q6ZVC0 841 aa29.69■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 GCKRQ14397 625 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 TNNI3KQ59H18 835 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 SLIT1O75093 1534 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 USP54Q70EL1 1684 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 KIF20AO95235 890 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ATP5JP18859 108 aa29.68■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.67■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 BECN2A8MW95 431 aa29.67■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.67■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 PTPN14Q15678 1187 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ENGASEQ8NFI3 743 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 KIF18AQ8NI77 898 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 CHST3Q7LGC8 479 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 AOPEPQ8N6M6 819 aa29.66■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 PFKFB2O60825 505 aa29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 COPS6Q7L5N1 327 aa29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.64■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.64■■■□□ 2.34
SENP3-201ENST00000321337 ERBB3P21860 1342 aa29.64■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 CAVIN2O95810 425 aa29.63■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 FSIP1Q8NA03 581 aa29.63■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 MRC1P22897 1456 aa29.63■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NPHP1O15259 732 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NBPF11Q86T75 865 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ME1P48163 572 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ELF2Q15723 593 aa29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 KINO60870 393 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 PSME1Q06323 249 aa29.61■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 COPRSQ9NQ92 184 aa29.61■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE5O15320 804 aa29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 FAM160A1Q05DH4 1040 aa29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.6■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GVL5 298 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 NCAPD2Q15021 1401 aa29.59■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 SLFN14P0C7P3 912 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 LRRN4CLQ8ND94 238 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 HAUS7Q99871 368 aa29.58■■■□□ 2.33
SENP3-201ENST00000321337 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms