RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
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HOXD8-201ENST00000313173 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 RASEFQ8IZ41 740 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 XAGE2Q96GT9 111 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC158Q5M9N0 1113 aa32.3■■■□□ 2.76
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HOXD8-201ENST00000313173 MAP4K1Q92918 833 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC12Q96J65 1359 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 ADORA1P30542 326 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 NECTIN1Q15223 517 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 ATP2B3Q16720 1220 aa32.28■■■□□ 2.76
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HOXD8-201ENST00000313173 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
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HOXD8-201ENST00000313173 GORABQ5T7V8 394 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 VGLL2Q8N8G2 317 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 RTL9Q8NET4 1388 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 RPS6KA4O75676 772 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 TTC39AQ5SRH9 613 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM37O94972 964 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 RAB3GAP1Q15042 981 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 TMX3Q96JJ7 454 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC152Q4G0S7 254 aa32.24■■■□□ 2.75
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HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ4P48050 445 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 TAF5LO75529 589 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 CREB3L3Q68CJ9 461 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 PDE8BO95263 885 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa32.22■■■□□ 2.75
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HOXD8-201ENST00000313173 NARFQ9UHQ1 456 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 TTC14Q96N46 770 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 ARAP2Q8WZ64 1704 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 GNPATO15228 680 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 CUL4AQ13619 759 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD8-201ENST00000313173 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.2■■■□□ 2.75
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC27A2O14975 620 aa32.2■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 RNF20Q5VTR2 975 aa32.2■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 CHGBP05060 677 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 MCM4P33991 863 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.19■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 HMG20BQ9P0W2 317 aa32.18■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 SSFA2P28290 1259 aa32.16■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM5Q71RC9 77 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 FGFR2P21802 821 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 SCARF1Q14162 830 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 ERFEQ4G0M1 354 aa32.16■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 LRRC4BQ9NT99 713 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
HOXD8-201ENST00000313173 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa32.14■■■□□ 2.74
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HOXD8-201ENST00000313173 TSGA10IPQ3SY00 556 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 VPS53Q5VIR6 699 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 C4AP0C0L4 1744 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 ZAP70P43403 619 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 SLC10A5Q5PT55 438 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXD8-201ENST00000313173 RUFY3Q7L099 469 aa32.12■■■□□ 2.73
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