RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299441.4

DCHS1-201, Transcript of dachsous cadherin-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DCHS1, Length 10,765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1-201ENST00000299441 NEK1Q96PY6 1258 aa15.95■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ATP2C2O75185 946 aa15.95■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SIRT1Q96EB6 747 aa15.95■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 HMGXB3Q12766 1538 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CTAGE5O15320 804 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZBTB43O43298 467 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ASIC1P78348 528 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.94■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 N4BP3O15049 544 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 FERP16591 822 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 PBRM1Q86U86 1689 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CCDC175P0C221 793 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ACTN2P35609 894 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TCHPQ9BT92 498 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 Q6ZUG5 572 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ALG1Q9BT22 464 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZMYND15Q9H091 742 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 KRT13P13646 458 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 GSTA5Q7RTV2 222 aa15.93■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 UIMC1Q96RL1 719 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TAF12Q16514 161 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 COPS6Q7L5N1 327 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 MCM3P25205 808 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 KRT23Q9C075 422 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 GBP3Q9H0R5 595 aa15.92■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 PRXQ9BXM0 1461 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 RXRAP19793 462 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TTC22Q5TAA0 569 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 MCM7P33993 719 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TNNI2P48788 182 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ABCC1P33527 1531 aa15.91■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CCDC102BQ68D86 513 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 GRIN2AQ12879 1464 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 ESR2Q92731 530 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 NCOA1Q15788 1441 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 FAM13AO94988 1023 aa15.9■□□□□ 0.14
DCHS1-201ENST00000299441 SMIM23A6NLE4 172 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 NLRP3Q96P20 1036 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 POLD1P28340 1107 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 GNPATO15228 680 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 DDB1Q16531 1140 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 AKR1B10O60218 316 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 BRF1Q92994 677 aa15.89■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 UBASH3AP57075 661 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 CCDC63Q8NA47 563 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 TNRQ92752 1358 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 FAM170AA1A519 330 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 MEIS3Q99687 375 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 CHMP2AO43633 222 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF165P49910 485 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 MXRA7P84157 204 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
DCHS1-201ENST00000299441 CEP112Q8N8E3 955 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms