RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 CRY2Q49AN0 593 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 BACH2Q9BYV9 841 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GUL7 405 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE8BO95263 885 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GUL6 1792 aa25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM10P62072 90 aa25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2B3Q16720 1220 aa25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 SDSP20132 328 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 GRAPQ13588 217 aa25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PACSIN3-201ENST00000298838 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRNDQ07001 517 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 AK9Q5TCS8 1911 aa25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE6BP35913 854 aa25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC45O75419 566 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 LPIN2Q92539 896 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 XAGE2Q96GT9 111 aa25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP5JP18859 108 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 GORABQ5T7V8 394 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF5LO75529 589 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 FGFR2P21802 821 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTROBQ8N137 903 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 RILPL2Q969X0 211 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC5A1P13866 664 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-201ENST00000298838 SRGNP10124 158 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ADORA1P30542 326 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 CASC1Q6TDU7 716 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 NPR1P16066 1061 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 BBOX1O75936 387 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE4AQ14139 1066 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 TMC4Q7Z404 712 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 EVI5LQ96CN4 794 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 MTFR1LQ9H019 292 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB7AO95365 584 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 MASTLQ96GX5 879 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 HAUS7Q99871 368 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YIN7 160 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 SNAP23O00161 211 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH1B1P30837 517 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ4P48050 445 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC102BQ68D86 513 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 XDHP47989 1333 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC24BO95487 1268 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 POLD1P28340 1107 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNA1SQ13698 1873 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 STYK1Q6J9G0 422 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 PHKA1P46020 1223 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMLP26374 656 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 FSD1Q9BTV5 496 aa25.16■■□□□ 1.62
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