RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297239.10

SYTL3-201, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-201ENST00000297239 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 NECTIN1Q15223 517 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 XAGE2Q96GT9 111 aa21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 SSFA2P28290 1259 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 PKP1Q13835 747 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 MAP4K1Q92918 833 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 FBXO3Q9UK99 471 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 BCORQ6W2J9 1755 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 METTL24Q5JXM2 366 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.48■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 NHSQ6T4R5 1651 aa21.47■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 SCARF1Q14162 830 aa21.47■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.47■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.47■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 NTSR2O95665 410 aa21.46■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.46■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 TAF5LO75529 589 aa21.46■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.46■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYTL3-201ENST00000297239 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 KCNB2Q92953 911 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 TTC14Q96N46 770 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SBF2Q86WG5 1849 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 PI16Q6UXB8 463 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 COL4A1P02462 1669 aa21.45■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 KCNJ4P48050 445 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SPEF2Q9C093 1822 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SLC27A2O14975 620 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ATP2B3Q16720 1220 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 GORABQ5T7V8 394 aa21.44■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 PARP10Q53GL7 1025 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 MCM2P49736 904 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 AK2P54819 239 aa21.43■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 LRP5O75197 1615 aa21.42■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SNAP23O00161 211 aa21.42■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CUL4AQ13619 759 aa21.42■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.42■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.42■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 RUFY3Q7L099 469 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 TAF1P21675 1872 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ATRNO75882 1429 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 LAMB2P55268 1798 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 PDE8BO95263 885 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 VPS53Q5VIR6 699 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 AK7Q96M32 723 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.4■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.39■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 CASZ1Q86V15 1759 aa21.39■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 GNPATO15228 680 aa21.39■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ZAP70P43403 619 aa21.39■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 ERFEQ4G0M1 354 aa21.39■■□□□ 1.02
SYTL3-201ENST00000297239 LARGE1O95461 756 aa21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 PTMSP20962 102 aa21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 MCAMP43121 646 aa21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 SCN7AQ01118 1682 aa21.39■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 LY75O60449 1722 aa21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 DTNBO60941 627 aa21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.38■■□□□ 1.01
SYTL3-201ENST00000297239 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms