RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.7□□□□□ -0.86
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ALDH1L1O75891 902 aa9.67□□□□□ -0.86
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.67□□□□□ -0.86
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.67□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABCC4O15439 1325 aa9.67□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 Q6ZNB5 142 aa9.66□□□□□ -0.86
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.64□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP44Q9H0E7 712 aa9.64□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.64□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNNQ9UQP3 1299 aa9.64□□□□□ -0.87
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CACNA1SQ13698 1873 aa9.63□□□□□ -0.87
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.63□□□□□ -0.87
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SUCLG2Q96I99 432 aa9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.63□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TAF1P21675 1872 aa9.62□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LMNB1P20700 586 aa9.62□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM161AQ3B820 660 aa9.62□□□□□ -0.87
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.62□□□□□ -0.87
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