RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283027.9

NUBP1-201, Transcript of nucleotide binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUBP1, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1-201ENST00000283027 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.7□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.69□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 MCTP1Q6DN14 999 aa14.69□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.69□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ATRNO75882 1429 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 A0A0G2JS52 829 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 A0A1B0GUL7 405 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 RGL2O15211 777 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 PDE8AO60658 829 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 MBD3O95983 291 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ITPK1Q13572 414 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 KLHL34Q8N239 644 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.68□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 HLFQ16534 295 aa14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 LRRC24Q50LG9 513 aa14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.67□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 MYH7P12883 1935 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 RPS6KB1P23443 525 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 CTSWP56202 376 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 TIMM10P62072 90 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 PKP1Q13835 747 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ARXQ96QS3 562 aa14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF445P59923 1031 aa14.65□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 PARP10Q53GL7 1025 aa14.65□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 FAM89AQ96GI7 184 aa14.65□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
NUBP1-201ENST00000283027 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 PDCP20941 246 aa14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 LAMB2P55268 1798 aa14.64□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 GOLIM4O00461 696 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 GORABQ5T7V8 394 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 XAGE2Q96GT9 111 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 NEK1Q96PY6 1258 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 LRP5O75197 1615 aa14.63□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 RTL9Q8NET4 1388 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 STX6O43752 255 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 CAMTA2O94983 1202 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ITGA6P23229 1130 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ILDR2Q71H61 639 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TCHHQ07283 1943 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 LAMA4Q16363 1823 aa14.62□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 ATP2B3Q16720 1220 aa14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 METTL24Q5JXM2 366 aa14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.61□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 BCORQ6W2J9 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
NUBP1-201ENST00000283027 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms