RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SLC51AQ86UW1 340 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SASH1O94885 1247 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 DLGAP5Q15398 846 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NCAPD2Q15021 1401 aa10.02□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NTSR2O95665 410 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SLX4Q8IY92 1834 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 USP17L3A6NCW0 530 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 USP17L4A6NCW7 530 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 EGFRP00533 1210 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NLRP10Q86W26 655 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.01□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 PLIN1O60240 522 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 GPSM2P81274 684 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NEXNQ0ZGT2 675 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 YDJCA8MPS7 323 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CHRDL2Q6WN34 429 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ZNF34Q8IZ26 560 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SBF1O95248 1867 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SP3Q02447 781 aa9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.99□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CLRN2A0PK11 232 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 INHBEP58166 350 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 VPS37DQ86XT2 251 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CSADQ9Y600 493 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 GTF2IP78347 998 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 NFE2L2Q16236 605 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 MYD88Q99836 296 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 POLLQ9UGP5 575 aa9.98□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 RGL2O15211 777 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 POTEFA5A3E0 1075 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 PODNQ7Z5L7 613 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ATP2B4P23634 1241 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 RAET1EQ8TD07 263 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.97□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.96□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.96□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.96□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 JAG2Q9Y219 1238 aa9.96□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 ERBB4Q15303 1308 aa9.96□□□□□ -0.81
LRP12-201ENST00000276654 PROSER3Q2NL68 480 aa9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 STK31Q9BXU1 1019 aa9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 FZD1Q9UP38 647 aa9.96□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 XDHP47989 1333 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 PPP2R1AP30153 589 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 SCN4AP35499 1836 aa9.95□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 MRC1P22897 1456 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 HOXD10P28358 340 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 MXD3Q9BW11 206 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 ELP3Q9H9T3 547 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms