RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261302.9

FOXN3-201, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene FOXN3, Length 2,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-201ENST00000261302 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TTC14Q96N46 770 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DACT1Q9NYF0 836 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 H3BQF6 201 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 ZNF853P0CG23 659 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CEP85Q6P2H3 762 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 USP16Q9Y5T5 823 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 HSPA4P34932 840 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 KRT85P78386 507 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 MAP2K7O14733 419 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CHMLP26374 656 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DNAI1Q9UI46 699 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 EVCP57679 992 aa14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 PIK3C2AO00443 1686 aa14.73□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GNAI3P08754 354 aa14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 RUFY3Q7L099 469 aa14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 A0A1W2PP64 1363 aa14.72□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GOLIM4O00461 696 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GJB2P29033 226 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 AK2P54819 239 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 GORABQ5T7V8 394 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TSPYL6Q8N831 410 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CARD6Q9BX69 1037 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.71□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 CCP110O43303 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SMC2O95347 1197 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SGSM3Q96HU1 749 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 VPS18Q9P253 973 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 USP54Q70EL1 1684 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 APBB1O00213 710 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 APOBRQ0VD83 1088 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 LRRC31Q6UY01 552 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 ABTB2Q8N961 1025 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 RNF217Q8TC41 542 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 FAM107BQ9H098 131 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 KIAA0232Q92628 1395 aa14.7□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC151A5D8V7 595 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 C21orf2O43822 256 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 ADAMTS2O95450 1211 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 USP8P40818 1118 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 FAM212AQ96EL1 285 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SGSM2O43147 1006 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SRGAP3O43295 1099 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 RABGGTAQ92696 567 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.69□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 KIF3CO14782 793 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 PPFIA4O75335 1185 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 BRD3Q15059 726 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 NBPF11Q86T75 865 aa14.68□□□□□ -0.06
FOXN3-201ENST00000261302 HOMER1Q86YM7 354 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms