RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD62A6NC57 917 aa10.35□□□□□ -0.75
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PTPRB-201ENST00000261266 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 DYNC1I1O14576 645 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf50Q9HD87 102 aa10.35□□□□□ -0.75
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PTPRB-201ENST00000261266 MSANTD4Q8NCY6 345 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 KRT13P13646 458 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TNNT1P13805 278 aa10.31□□□□□ -0.76
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