RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 GPR108Q9NPR9 543 aa22.08■■□□□ 1.13
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CBX1-201ENST00000225603 NBR1Q14596 966 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX1-201ENST00000225603 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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CBX1-201ENST00000225603 PDE8BO95263 885 aa22.04■■□□□ 1.12
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CBX1-201ENST00000225603 ERC2O15083 957 aa22.01■■□□□ 1.11
CBX1-201ENST00000225603 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.01■■□□□ 1.11
CBX1-201ENST00000225603 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22■■□□□ 1.11
CBX1-201ENST00000225603 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22■■□□□ 1.11
CBX1-201ENST00000225603 BRIP1Q9BX63 1249 aa22■■□□□ 1.11
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CBX1-201ENST00000225603 GRAPQ13588 217 aa21.99■■□□□ 1.11
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CBX1-201ENST00000225603 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.9■■□□□ 1.1
CBX1-201ENST00000225603 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 BCAMP50895 628 aa21.89■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.88■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 CHRNA5P30532 468 aa21.88■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 MCAMP43121 646 aa21.88■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 GOLIM4O00461 696 aa21.88■■□□□ 1.09
CBX1-201ENST00000225603 MASTLQ96GX5 879 aa21.88■■□□□ 1.09
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