RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PFKFB2O60825 505 aa26.07■■□□□ 1.76
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HTATSF1-201ENST00000218364 SCRN1Q12765 414 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A6Q13433 755 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SARM1Q6SZW1 724 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.06■■□□□ 1.76
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HTATSF1-201ENST00000218364 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCB1Q15051 598 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX11Q96FC9 970 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 CTAGE5O15320 804 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SYCP1Q15431 976 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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HTATSF1-201ENST00000218364 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 ATL3Q6DD88 541 aa26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 TICAM2Q86XR7 235 aa26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 ORAI2Q96SN7 254 aa26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.03■■□□□ 1.76
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HTATSF1-201ENST00000218364 CHGBP05060 677 aa26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP2B3Q16720 1220 aa26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 PALLDQ8WX93 1383 aa26.01■■□□□ 1.76
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CTDNEP1O95476 244 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 STX1AQ16623 288 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 PHKG2P15735 406 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CASP7P55210 303 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 DMTNQ08495 405 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 DSCC1Q9BVC3 393 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 HELLSQ9NRZ9 838 aa26■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 TNNT1P13805 278 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 NEMFO60524 1076 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 USP16Q9Y5T5 823 aa25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 FGD1P98174 961 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CBX1P83916 185 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 MST1RQ04912 1400 aa25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.97■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.752e-7■■■■■ 37.7
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HTATSF1-201ENST00000218364 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 USP28Q96RU2 1077 aa25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMA4Q16363 1823 aa25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 RGPD5Q99666 1765 aa25.96■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.95■■□□□ 1.75
HTATSF1-201ENST00000218364 APOBRQ0VD83 1088 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR108Q9NPR9 543 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM94Q12767 1356 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.95■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
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