RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 IntuQ059U7 942 aa21.56■■□□□ 1.04
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ift57Q8BXG3 429 aa21.56■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Col3a1P08121 1464 aa21.56■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam84aQ9D650 292 aa21.55■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ambra1A2AH22 1300 aa21.55■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Oas2E9Q9A9 742 aa21.55■■□□□ 1.04
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 TnksQ6PFX9 1320 aa21.53■■□□□ 1.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Scn11aQ9R053 1765 aa21.52■■□□□ 1.04
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam160b2Q80YR2 744 aa21.5■■□□□ 1.03
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rnf123Q5XPI3 1314 aa21.49■■□□□ 1.03
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Psd3Q2PFD7 1037 aa21.49■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ZyxQ62523 564 aa21.49■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nlrp9aQ66X03 949 aa21.49■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Col4a5Q63ZW6 1691 aa21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Htatsf1Q8BGC0 757 aa21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rdm1Q9CQK3 281 aa21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Osbpl5Q9ER64 874 aa21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ParvgQ9ERD8 331 aa21.48■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gja5Q01231 358 aa21.46■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa21.46■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc14a2Q8R4T9 930 aa21.46■■□□□ 1.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Terf2O35144 541 aa21.45■■□□□ 1.03
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa21.45■■□□□ 1.03
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa21.45■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa21.45■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prl3d1P18121 224 aa21.45■■□□□ 1.02
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mdm2P23804 489 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 NpeppsQ11011 920 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gpr150Q8BL07 427 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 UvssaQ9D479 717 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Phrf1A6H619 1682 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dok7Q18PE0 504 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Abtb2Q7TQI7 1024 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa21.43■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ArxO35085 564 aa21.42■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Top1mtQ8R4U6 593 aa21.42■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ube3bQ9ES34 1070 aa21.42■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slfn1Q9Z0I7 337 aa21.42■■□□□ 1.02
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa21.41■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ppp4r3bQ922R5 820 aa21.41■■□□□ 1.02
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bcl11aQ9QYE3 773 aa21.41■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sytl4Q9R0Q1 673 aa21.41■■□□□ 1.02
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa21.39■■□□□ 1.02
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bmp2kQ91Z96 1138 aa21.39■■□□□ 1.02
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 EngaseQ8BX80 734 aa21.39■■□□□ 1.01
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Izumo3A6PWV3 263 aa21.38■■□□□ 1.01
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MccE9PWI3 1003 aa21.38■■□□□ 1.01
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nup188Q6ZQH8 1759 aa21.38■■□□□ 1.01
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tango6Q8C3S2 1079 aa21.38■■□□□ 1.01
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rad50P70388 1312 aa21.37■■□□□ 1.01
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Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tshz3Q8CGV9 1081 aa21.37■■□□□ 1.01
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