RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2RP11717 2491 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BMQ9 156 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR171O14626 319 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GABARAPO95166 117 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-ND5P03915 603 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOX5APP20292 161 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LAP3P28838 519 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD1P49961 510 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OR12D2P58182 307 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 BDH1Q02338 343 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TPBGQ13641 420 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MEP1BQ16820 701 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00303Q3SY05 128 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf128Q5T292 105 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 AAED1Q7RTV5 226 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ATCAYQ86WG3 371 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KLBQ86Z14 1044 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OTOSQ8NHW6 89 aa22.06■■□□□ 1.12
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTTY10Q9BZA0 68 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QLW9 94 aa22.05■■□□□ 1.12
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF19P17023 458 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS27P42677 84 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPZA2P47755 286 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM8P78325 824 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CTF1Q16619 201 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PCK2Q16822 640 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX30Q5JUR7 227 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF684Q5T5D7 378 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OTPQ5XKR4 325 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PHC2Q8IXK0 858 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX33Q8WV41 574 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL7BQ9BQE9 202 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 BCO1Q9HAY6 547 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMP5Q9UJQ1 280 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF175Q9Y473 711 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF724A8MTY0 619 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR32B1ATL7 298 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC43A1O75387 559 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF823P16415 610 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53I3Q53FA7 332 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPKQ5VXJ0 399 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFB11Q9NX14 153 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC3Q9P0I2 261 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LUZP4Q9P127 313 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNG2Q9UJ96 466 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GTH9 108 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PHYHO14832 338 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 UFD1Q92890 307 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM36Q9NQ86 728 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPL8 197 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM6O95932 706 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SPARCP09486 303 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM87AP0C7U9 286 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TUSC5Q8IXB3 177 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 THEM6Q8WUY1 208 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14I1A6ND48 311 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM64BA6NI03 449 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A20A6NK97 555 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DHHO43323 396 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EGR3Q06889 387 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNMB1Q16558 191 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP41Q8N8Y5 198 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF454Q8N9F8 522 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8NA96 180 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PELI1Q96FA3 418 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR137Q96N19 417 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 AMELYQ99218 206 aa22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1GO43497 2377 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 E9PI62 339 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNHIT1O43257 154 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 UPK3AO75631 287 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ATE1O95260 518 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 YES1P07947 543 aa22.01■■□□□ 1.11
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