RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC9A3P48764 834 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 FXNQ16595 210 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKDD1AQ495B1 522 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 FGD3Q5JSP0 725 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM205BPQ63HN1 556 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SEMA3B-215ENST00000621029 A6NIZ1 184 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MGRN1O60291 552 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS23O95084 383 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 H1F0P07305 194 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 APLNRP35414 380 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH3B1P43353 468 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 RAP1BP61224 184 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 RAP1AP62834 184 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 THEM4Q5T1C6 240 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP11Q86VZ4 500 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CLDN22Q8N7P3 220 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ICA1LQ8NDH6 482 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TSPAN32Q96QS1 320 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NDEL1Q9GZM8 345 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MS4A5Q9H3V2 200 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD19PQ9H560 264 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 V9GYQ6 96 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 STAMBPO95630 424 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHMP01871 453 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LCKP06239 509 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV4-31P0DP07 118 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 APEHP13798 732 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CCNOP22674 350 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SELENOVP59797 346 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVK-25P63136 954 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT72Q14CN4 511 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC75AQ8NAA5 344 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FNDC8Q8TC99 324 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 UBASH3BQ8TF42 649 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 BPESC1Q9GZL8 116 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 GRHPRQ9UBQ7 328 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM5Q9Y2B1 443 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1W2PPL8 197 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 APEX1P27695 318 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBED5Q49AG3 693 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 PODNL1Q6PEZ8 512 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC7A13Q8TCU3 470 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC42EP2O14613 210 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF32P17041 273 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 RHCEP18577 417 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 RAD52P43351 418 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 GZMKP49863 264 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NKPD1Q17RQ9 610 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF519Q8TB69 540 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NABP1Q96AH0 204 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 H7C1C5 153 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 XKRYO14609 159 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 DIRAS1O95057 198 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LCN6P62502 163 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 MXRA7P84157 204 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FHL1Q13642 323 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ALKBH6Q3KRA9 238 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 CHRFAM7AQ494W8 412 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF786Q8N393 782 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM86B1Q8N7N1 296 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf40Q8WZ69 217 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 TAGLN3Q9UI15 199 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1W2PRQ8 180 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LYNX1G3V0Z9 82 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAP29O95721 258 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LYNX1P0DP58 116 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 STOMP27105 288 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 LAP3P28838 519 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 UCP2P55851 309 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 DGCR6Q14129 220 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM27BQ5VT28 67 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms