RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616635.1

uc_338.4-201, humanhuman

BASIC

Gene uc_338, Length 176 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
uc_338.4-201ENST00000616635 ZNF735P0CB33 412 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 STMN1P16949 149 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 AK4P27144 223 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CCR1P32246 355 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RORAP35398 523 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ATP6V1E1P36543 226 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 FDFT1P37268 417 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CEACAM6P40199 344 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CDKN1BP46527 198 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RGS4P49798 205 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 PPT1P50897 306 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RORCP51449 518 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ZNF138P52744 262 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CDK16Q00536 496 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 OGDHQ02218 1023 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ZNF92Q03936 586 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 IFT88Q13099 833 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 MAB21L1Q13394 359 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 MESDQ14696 234 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 INAQ16352 499 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 DGUOKQ16854 277 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 USH1GQ495M9 461 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 FILIP1LQ4L180 1135 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SFT2D3Q587I9 215 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 GUSBP11Q6P575 273 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ARL9Q6T311 187 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 FBXW12Q6X9E4 464 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 TEX43Q6ZNM6 134 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 TMEM179Q6ZVK1 233 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ASCL5Q7RTU5 278 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 HDDC2Q7Z4H3 204 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 LHFPL3Q86UP9 236 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CALHM1Q8IU99 346 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CEP112Q8N8E3 955 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ANKFN1Q8N957 763 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 ZNF680Q8NEM1 530 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 LILRB4Q8NHJ6 448 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 TMEM54Q969K7 222 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SLC25A46Q96AG3 418 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CXorf40BQ96DE9 158 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 OR8B4Q96RC9 309 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CLCC1Q96S66 551 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SORT1Q99523 831 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SH3GL3Q99963 347 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RARRES2Q99969 163 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 TCHPQ9BT92 498 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 SLC25A2Q9BXI2 301 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 COQ10BQ9H8M1 238 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 DBNDD1Q9H9R9 158 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RAB23Q9ULC3 237 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 CDHR2Q9BYE9 1310 aa0.35□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa0.34□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 GPRASP1Q5JY77 1395 aa0.34□□□□□ -2.35
uc_338.4-201ENST00000616635 RGSL1A5PLK6 1076 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 C5orf63A6NC05 138 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 METTL21EPA6NDL7 271 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 C3orf84H3BNL1 204 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 OVOL1O14753 267 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 FCMRO60667 390 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 RAB3DO95716 219 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 HLA-DQB1P01920 261 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 SLC2A5P22732 501 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 MAS1LP35410 378 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 SERPINB5P36952 375 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 MDH1P40925 334 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 GZMMP51124 257 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 FUT5Q11128 374 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 PRPSAP1Q14558 356 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 IHHQ14623 411 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 ZSCAN26Q16670 478 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 TTC23Q5W5X9 447 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 OR4F3Q6IEY1 312 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 PLET1Q6UQ28 207 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 ENPP6Q6UWR7 440 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 CASP12Q6UXS9 341 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 SLC16A13Q7RTY0 426 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 NUDCD3Q8IVD9 361 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 ZNF683Q8IZ20 524 aa0.34□□□□□ -2.36
uc_338.4-201ENST00000616635 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms