RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SKA3Q8IX90 412 aa28.89■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa28.83■■■□□ 2.21
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