RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542862.1

ERVFRD-1-202, Transcript of endogenous retrovirus group FRD member 1, envelope, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene ERVFRD-1, Length 3,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1-202ENST00000542862 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 HSF2Q03933 536 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 FOXF1Q12946 379 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SGCBQ16585 318 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 LINC00303Q3SY05 128 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ZNF519Q8TB69 540 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 OR8B4Q96RC9 309 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ARID1AO14497 2285 aa7.13□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 C7orf66A4D0T2 115 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 G3V3Y1 287 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 GPR171O14626 319 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PDCD5O14737 125 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SIGLEC6O43699 453 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 KRT33AO76009 404 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ALDOBP05062 364 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ANOS1P23352 680 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 EPHA4P54764 986 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SPOCK1Q08629 439 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 RNF144BQ7Z419 303 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 GPR148Q8TDV2 347 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MVB12AQ96EY5 273 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 C5orf34Q96MH7 638 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SLITRK2Q9H156 845 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PATE3B3GLJ2 98 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 RAMP1O60894 148 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SCRG1O75711 98 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SIX6O95475 246 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 S100A1P23297 94 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 POU3F4P49335 361 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 CARD17Q5XLA6 110 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 GRINAQ7Z429 371 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NKD1Q969G9 470 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NXPE2Q96DL1 559 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MSANTD3Q96H12 275 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 LRP12Q9Y561 859 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MEN1O00255 615 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TO15178 435 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 OR2J2O76002 312 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 EMP2P54851 167 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 DCAF7P61962 342 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MFAP5Q13361 173 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 EID2Q8N6I1 236 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 MIB2Q96AX9 1013 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 HAVCR1Q96D42 359 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SOX7Q9BT81 388 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 NOX3Q9HBY0 568 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 CA10Q9NS85 328 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.12□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 KNTC1P50748 2209 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 P2RY10O00398 339 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SLC2A1P11166 492 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 CDAP32320 146 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 SFTPDP35247 375 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 CAPZA2P47755 286 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 STARD6P59095 220 aa7.11□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-202ENST00000542862 TNK1Q13470 666 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms