RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534111.5

TMPRSS4-218, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMPRSS4, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-218ENST00000534111 CATR1Q13166 79 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GSG1Q2KHT4 349 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TEX29Q8N6K0 151 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 FOXB1Q99853 325 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SPTA1P02549 2419 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 A0A096LPE4 126 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 A0A1W2PPZ6 126 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CLDN24A6NM45 220 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 J3QRK9 145 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 BDKRB2P30411 391 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GNB2P62879 340 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 OR10D3Q8NH80 312 aa9.51□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GASTP01350 101 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SERPINE2P07093 398 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 UBBP0CG47 229 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SERPINA2P20848 420 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 PRSS3P35030 304 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TPRA1Q86W33 373 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SPIN2AQ99865 258 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 UBQLN3Q9H347 655 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TSPAN4O14817 238 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 EML2O95834 649 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TK1P04183 234 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 LIFP15018 202 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 HNF1AP20823 631 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 BMXP51813 675 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 NEU3Q9UQ49 428 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 K7ESF4 209 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SQSTM1Q13501 440 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 MEP1BQ16820 701 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF573Q86YE8 665 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 C12orf10Q9HB07 376 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 M0R135 149 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SFTPBP07988 381 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CD97P48960 835 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 RAC3P60763 192 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CD83Q01151 205 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 FZD5Q13467 585 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SHBQ15464 509 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF799Q96GE5 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 V9GY05 133 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 A0A1W2PQD3 144 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF732B4DXR9 585 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 MYF6P23409 242 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 DDOSTP39656 456 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 CX3CR1P49238 355 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 OR2M7Q8NG81 312 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SLC6A7Q99884 636 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.5□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 GAB4Q2WGN9 574 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM99Q8N816 258 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 COQ8AQ8NI60 647 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 RASD2Q96D21 266 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 KCNJ15Q99712 375 aa9.49□□□□□ -0.89
TMPRSS4-218ENST00000534111 JAM3Q9BX67 310 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.7 ms