RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 NT5DC3Q86UY8 548 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 WDFY1Q8IWB7 410 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CEP112Q8N8E3 955 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2L3Q8NG85 312 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR4D5Q8NGN0 318 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR6N1Q8NGY5 312 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PYROXD1Q8WU10 500 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SHC3Q92529 594 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OSTF1Q92882 214 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBE2E3Q969T4 207 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM159Q96B96 161 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MED8Q96G25 268 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C4orf36Q96KX1 117 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF488Q96MN9 340 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C18orf15Q96N68 181 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IP6K3Q96PC2 410 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PKMYT1Q99640 499 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SH3GL3Q99963 347 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RARRES2Q99969 163 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBL1YQ9BQ87 522 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RHOXF2Q9BQY4 288 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF649Q9BS31 505 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAIM2Q9BWQ8 316 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM59Q9BXS4 323 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR52D1Q9H346 318 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FN3KRPQ9HA64 309 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NEK6Q9HC98 313 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADAP2Q9NPF8 381 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 UVRAGQ9P2Y5 699 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTSFQ9UBX1 484 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PCSK1NQ9UHG2 260 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMCO1Q9UM00 188 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHMP2BQ9UQN3 213 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MEMO1Q9Y316 297 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CBY1Q9Y3M2 126 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IKBKGQ9Y6K9 419 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DLG5Q8TDM6 1919 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CACNA1SQ13698 1873 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PCDH15Q96QU1 1955 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAST4O15021 2626 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A0B4J2A0 478 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C4orf51C9J302 202 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRKAB2O43741 272 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAMP3O60896 148 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCGB2A1O75556 95 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DIRAS1O95057 198 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 H6PDO95479 791 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAB3DO95716 219 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 LHBP01229 141 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGLV3-25P01717 112 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV2-5P01817 119 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV1-16P04430 117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FGF1P05230 155 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASGR1P07306 291 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PFN1P07737 140 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR8U9P0C7N5 309 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF688P0C7X2 276 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 INAFM2P0DMQ5 153 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IFI30P13284 250 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TCP1P17987 556 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC2A5P22732 501 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ME2P23368 584 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 GNA11P29992 359 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCND2P30279 289 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SSTR5P35346 364 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAS1LP35410 378 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SERPINB5P36952 375 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SYKP43405 635 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDKN1BP46527 198 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RORCP51449 518 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OGDHQ02218 1023 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TCP10Q12799 353 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DPYSL2Q16555 572 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZSCAN26Q16670 478 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DGUOKQ16854 277 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PCOTHQ58A44 107 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM41BQ5BJD5 291 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DMRTC1Q5HYR2 192 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 WDR59Q6PJI9 974 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLET1Q6UQ28 207 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FBXW12Q6X9E4 464 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASCL5Q7RTU5 278 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PEX26Q7Z412 305 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms