RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4K13Q8NH42 304 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC61A2Q9H9S3 476 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT84Q9NSB2 600 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GNT2Q9NY97 397 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-212ENST00000508338 RIIAD1A6NNX1 92 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PTHP01270 115 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IGLV1-44P01699 117 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGN1P05114 100 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 MSR1P21757 451 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PCBD1P61457 104 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PGGHGQ32M88 737 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SKA3Q8IX90 412 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 NMNAT3Q96T66 252 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PKP2Q99959 881 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RACGAP1Q9H0H5 632 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf198Q9H425 327 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 OAZ3Q9UMX2 235 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 FKBP7Q9Y680 259 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA12Q86UK0 2595 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPL8 197 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HLA-HP01893 362 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CTLA4P16410 223 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF3P17036 446 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 POU1F1P28069 291 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 LAP3P28838 519 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 GIPRP48546 466 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 DAPP51397 102 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB1AP62820 205 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SGCAQ16586 387 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT9Q86SS6 491 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 MDP1Q86V88 176 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ICA1LQ8NDH6 482 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 LURAP1Q96LR2 239 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PRRG3Q9BZD7 231 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 NUAK2Q9H093 628 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCD4O14678 606 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CRYAAP02489 173 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CST2P09228 141 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 GLO1Q04760 184 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM4DQ6B0I6 523 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SDR9C7Q8NEX9 313 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2T4Q8NH00 348 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 NABP1Q96AH0 204 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SH3GL3Q99963 347 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF121Q9H920 327 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 POLE4Q9NR33 117 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CMC2Q9NRP2 79 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ITPR2Q14571 2701 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 APCP25054 2843 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 C12orf71A8MTZ7 269 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CDAP32320 146 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBA1BP68363 451 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBA4AP68366 448 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PLP2Q04941 152 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 GINS1Q14691 196 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 C20orf204Q6ZNR8 217 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBA1AQ71U36 451 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PQLC1Q8N2U9 271 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RERGLQ9H628 205 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF224Q9NZL3 707 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 B9D1Q9UPM9 204 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CADP27708 2225 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PAICSP22234 425 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IGFBP5P24593 272 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CENPAP49450 140 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CRISP1P54107 249 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 LSM6P62312 80 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK5Q00535 292 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A25Q6T423 547 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC18Q8N456 261 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ORC6Q9Y5N6 252 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6C68A6NDL8 312 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 CECR9P0C854 216 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 BLVRAP53004 296 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A1P53007 311 aa23.34■■□□□ 1.33
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