RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.16□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.16□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.15□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 LRBAP50851 2863 aa3.15□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.15□□□□□ -1.9
POLR1B-215ENST00000498054 PTPRBP23467 1997 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OR10H3O60404 316 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 LY6G6DO95868 133 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 LGALS2P05162 132 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 P0C879 139 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CALM1P0DP23 149 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CALM2P0DP24 149 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CALM3P0DP25 149 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IDO1P14902 403 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CD1EP15812 388 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IGLL1P15814 213 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IMPDH1P20839 514 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 IVDP26440 423 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GCAP28676 217 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 FOXN2P32314 431 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 LEPP41159 167 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RANBP1P43487 201 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RAP1GDS1P52306 607 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP10-12P60413 245 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 CHRNB3Q05901 458 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MARCH8Q5T0T0 291 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BLIDQ8IZY5 108 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PRELID2Q8N945 189 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 GAL3ST1Q99999 423 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SELENOSQ9BQE4 189 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLITRK2Q9H156 845 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 VCX3BQ9H321 246 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF702PQ9H963 129 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 POLE4Q9NR33 117 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.15□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PTPRDP23468 1912 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.15□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1B0GUS0 222 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1B0GWB2 263 aa3.14□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 ZNF264O43296 627 aa3.14□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 RETP07949 1114 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MMP11P24347 488 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CRABP2P29373 138 aa3.14□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 CD52P31358 61 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PCK1P35558 622 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PLK1P53350 603 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IL24Q13007 206 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CHIT1Q13231 466 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HTR4Q13639 388 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PDK3Q15120 406 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RNF212Q495C1 297 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 LIN52Q52LA3 116 aa3.14□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.14□□□□□ -1.91
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