RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 IZUMO2Q6UXV1 221 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TRILQ7L0X0 811 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 LINC00471Q8N535 108 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PACRGLQ8N7B6 248 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SMPDL3BQ92485 455 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TAAR8Q969N4 342 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 DDIT4LQ96D03 193 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SGTBQ96EQ0 304 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 RITA1Q96K30 269 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SFXN2Q96NB2 322 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 DGCR6LQ9BY27 220 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 VCXQ9H320 206 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 VCX3BQ9H321 246 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KRT84Q9NSB2 600 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.89□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MED12Q93074 2177 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CACNA1AO00555 2505 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TRAV27A0A087WT01 109 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFSF11O14788 317 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNHIT1O43257 154 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SEC14L5O43304 696 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PTP4A3O75365 173 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR7A10O76100 309 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SOX14O95416 240 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 AHSA1O95433 338 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SNAP29O95721 258 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IGF2P01344 180 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GSTM3P21266 225 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CHMP24386 653 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 EPHA2P29317 976 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GRPRP30550 384 aa4.88□□□□□ -1.63
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GAPVD1-218ENST00000495588 LHX2P50458 406 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CLDN15P56746 228 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CLDN18P56856 261 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FXYD6P3P58550 94 aa4.88□□□□□ -1.63
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GAPVD1-218ENST00000495588 TSPAN31Q12999 210 aa4.88□□□□□ -1.63
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GAPVD1-218ENST00000495588 FHL1Q13642 323 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 LY6DQ14210 128 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC10A1Q14973 349 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR7A5Q15622 319 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 INAQ16352 499 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC36A3Q495N2 470 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GXYLT1Q4G148 440 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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GAPVD1-218ENST00000495588 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SIAH3Q8IW03 269 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR51A7Q8NH64 312 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FANK1Q8TC84 345 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ADGRG7Q96K78 797 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR5B2Q96R09 309 aa4.88□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MBOAT4Q96T53 435 aa4.88□□□□□ -1.63
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