RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF117Q03924 483 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EGR4Q05215 589 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LGALS3BPQ08380 585 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ASAH1Q13510 395 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF74Q16587 644 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PLET1Q6UQ28 207 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CMIPQ8IY22 773 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF721Q8TF20 911 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B8Q92506 261 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LPAR4Q99677 370 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GAL3ST1Q99999 423 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ALG12Q9BV10 488 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GTH9 108 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TMEM72A0PK05 275 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BLACEA4D250 179 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PRR32B1ATL7 298 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 J3QKU1 62 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LANCL1O43813 399 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR2T7P0C7T2 308 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RIN1Q13671 783 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TSC22D1Q15714 1073 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GRK1Q15835 563 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HBMQ6B0K9 141 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KRT74Q7RTS7 529 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR2T27Q8NH04 317 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TAAR8Q969N4 342 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MVB12AQ96EY5 273 aa6.32□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 ARL5BQ96KC2 179 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MMP25Q9NPA2 562 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TINAGQ9UJW2 476 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 A0A0B4J293 547 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 APOC3P02656 99 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IGKV3-11P04433 115 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2ABP04908 130 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CD14P08571 375 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RD3LP0DJH9 198 aa6.32□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 CXCR1P25024 350 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SOX2P48431 317 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NRG3P56975 720 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R43P59537 309 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 POU4F2Q12837 409 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MAB21L1Q13394 359 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CDK5R1Q15078 307 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KDM8Q8N371 416 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EXD3Q8N9H8 876 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 YIPF5Q969M3 257 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LINC00052Q96N35 136 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NIT2Q9NQR4 276 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.32□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LYRM1O43325 122 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IFNA7P01567 189 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PNMTP11086 282 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ATF1P18846 271 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PCP4P48539 62 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CLDN12P56749 244 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PRPS1P60891 318 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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