RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 FOSL1P15407 271 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SDHAP31040 664 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CD47Q08722 323 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 TSPAN31Q12999 210 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SLC36A2Q495M3 483 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 MESTQ5EB52 335 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 Q5PR19 223 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 OR2T29Q8NH02 315 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 LRGUKQ96M69 825 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.26□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RAB36O95755 333 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 NR4A1P22736 598 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CDAP32320 146 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CDKN1AP38936 164 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ATP5J2P56134 94 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 NPRL3Q12980 569 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 GK3PQ14409 553 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RAB39AQ14964 217 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 EFNB3Q15768 340 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ADIPOQQ15848 244 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ETFDHQ16134 617 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 HTRA1Q92743 480 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF570Q96NI8 536 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 WACQ9BTA9 647 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CHID1Q9BWS9 393 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 OR52D1Q9H346 318 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 IL20Q9NYY1 176 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 POMPQ9Y244 141 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.25□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 MTORP42345 2549 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 H7C417 338 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 IDH3BO43837 385 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 STAMBPO95630 424 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 GASTP01350 101 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SERPINF1P36955 418 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RASSF2P50749 326 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RPS6KA3P51812 740 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 MICAQ29983 383 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC18Q8N456 261 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 NSMAFQ92636 917 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RASD2Q96D21 266 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SNX18Q96RF0 628 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf198Q9H425 327 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 VNN3Q9NY84 501 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.24□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM129A0AVI4 362 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 B9A039 149 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 XKRYO14609 159 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 NDUFS7O75251 213 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CCNB2O95067 398 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PTHP01270 115 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV4-39P01824 125 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SCG5P05408 212 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CST2P09228 141 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 OR4A8P0C604 315 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 BMP4P12644 408 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SLC6A6P31641 620 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 THBS4P35443 961 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 GLRXP35754 106 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SGCAQ16586 387 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SYT9Q86SS6 491 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 ADCK1Q86TW2 530 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO17Q96EF6 278 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PLK3Q9H4B4 646 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RNF121Q9H920 327 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 RTTNQ86VV8 2226 aa14.23□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 DHRS12A0PJE2 317 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 VSTM5A8MXK1 200 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 H7C1C5 153 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 SNAP29O95721 258 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 LAP3P28838 519 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 EVX1P49640 407 aa14.22□□□□□ -0.13
ATG4B-216ENST00000475195 LCN6P62502 163 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms