RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SPATC1Q76KD6 591 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 POC1BQ8TC44 478 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PHYHIPQ92561 330 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM46BQ96A09 425 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 H3BUI4 141 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF208O43345 1280 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NKX2-2O95096 273 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HPP00738 406 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TCRBP04435 133 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 WNT1P04628 370 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ACP2P11117 423 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FPR3P25089 353 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BDKRB2P30411 391 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MAGEB1P43366 347 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GCGRP47871 477 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CLRN1P58418 232 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HBMQ6B0K9 141 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 AWAT2Q6E213 333 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LRFN1Q9P244 771 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FITM1A5D6W6 292 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 E9PQ18 207 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF264O43296 627 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RNF13O43567 381 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF254O75437 659 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CH25HO95992 272 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MBP02144 154 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NID1P14543 1247 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PAX6P26367 422 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GPR85P60893 370 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SRYQ05066 204 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MELKQ14680 651 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DUSP5Q16690 384 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FHL5Q5TD97 284 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 VRK2Q86Y07 508 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR8S1Q8NH09 359 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ADOQ96SZ5 270 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SYT3Q9BQG1 590 aa6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BET1O15155 118 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF43P17038 809 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 S1PR1P21453 382 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MMP11P24347 488 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MTNR1BP49286 362 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PNLIPRP2P54317 469 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RAB1AP62820 205 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RAB11BQ15907 218 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 AANATQ16613 207 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 C12orf73Q69YU5 71 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 UQCC3Q6UW78 93 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 UEVLDQ8IX04 471 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LFNGQ8NES3 379 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TMEM163Q8TC26 289 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RLIMQ9NVW2 624 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 UNC119BA6NIH7 251 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SULT2B1O00204 365 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GPRIN2O60269 458 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HPGDSO60760 199 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HBE1P02100 147 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TPOP07202 933 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TGM1P22735 817 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 XAF1Q6GPH4 301 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CD163Q86VB7 1156 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 COMTD1Q86VU5 262 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms