RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ADIPOQQ15848 244 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE2CQ5TA81 110 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LCN8Q6JVE9 175 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT80Q6KB66 452 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO17Q96EF6 278 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DOK1Q99704 481 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf21Q9H246 121 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CA10Q9NS85 328 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FZR1Q9UM11 496 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 EDARQ9UNE0 448 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DYSFO75923 2080 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC119BA6NIH7 251 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPBD1B2RD01 187 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R3DO95685 299 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LY6G6DO95868 133 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPTM1O96005 669 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GASTP01350 101 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP3P05413 133 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A8P0C604 315 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CTLA4P16410 223 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF32P17041 273 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA8P32881 189 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ARR3P36575 388 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CD47Q08722 323 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SGCAQ16586 387 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GSG1Q2KHT4 349 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP6Q5VW22 663 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF544Q6NX49 715 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SSX8Q7RTT4 187 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DHFR2Q86XF0 187 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK20Q8IZL9 346 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD8Q96LT4 415 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TSSK2Q96PF2 358 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DDOQ99489 341 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS37A4D1T9 235 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF11BO00300 401 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS2O14508 198 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GSC2O15499 205 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SSX4O60224 188 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10H3O60404 316 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ICMTO60725 284 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GMNNO75496 209 aa6.03□□□□□ -1.44
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