RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HS3ST1O14792 307 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 E2F6O75461 281 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT36O76013 467 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TXNDC12O95881 172 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WNT11O96014 354 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGKV3-15P01624 115 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAAP10253 952 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCL2P13500 99 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOS3P29474 1203 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC6A6P31641 620 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PYCR1P32322 319 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GIPRP48546 466 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RASSF2P50749 326 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NR1H2P55055 460 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAAAQ02083 359 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB39AQ14964 217 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP6AP1Q15904 470 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGGHGQ32M88 737 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RFX4Q33E94 735 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF627Q7L945 461 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO17Q96EF6 278 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BOD1Q96IK1 185 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NMNAT3Q96T66 252 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PKP2Q99959 881 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR51B6Q9H340 312 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLE4Q9NR33 117 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.17□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR6C68A6NDL8 312 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A6NIZ1 184 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CENPBD1B2RD01 187 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GNGT2O14610 69 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPRIN2O60269 458 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC16A7O60669 478 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOSR1O95249 250 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAF1P04049 648 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GYPBP06028 91 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLUP10909 449 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF32P17041 273 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANOS1P23352 680 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LAP3P28838 519 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDKN1AP38936 164 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPS6KA3P51812 740 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACTR3P61158 418 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAP1BP61224 184 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERVS71-1P61550 626 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAP1AP62834 184 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HGFACQ04756 655 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRMP1Q14194 572 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAF11Q15544 211 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SGCAQ16586 387 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GSG1Q2KHT4 349 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VHLLQ6RSH7 139 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC22A25Q6T423 547 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RADILQ96JH8 1075 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCL19Q99731 98 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUAK2Q9H093 628 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MED20Q9H944 212 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTORP42345 2549 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TVP23AA6NH52 213 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM183AA6NL82 134 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms