RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PHYHIPQ92561 330 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 AP3S1Q92572 193 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ADGRG7Q96K78 797 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ACOXLQ9NUZ1 547 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.62■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 KLK10O43240 276 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CXCL13O43927 109 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CDRT1O95170 752 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SYNGR4O95473 234 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 FMODQ06828 376 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 FOXC1Q12948 553 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ETFDHQ16134 617 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF679Q8IYX0 411 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 NSMAFQ92636 917 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 GHSRQ92847 366 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 LDAHQ9H6V9 325 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RCE1Q9Y256 329 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 E9PI62 339 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CASKO14936 926 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF254O75437 659 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 MYL9P24844 172 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RFC3P40938 356 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 STARP49675 285 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ROM1Q03395 351 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 HIST3H3Q16695 136 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CARD17Q5XLA6 110 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 KRT77Q7Z794 578 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ABHD4Q8TB40 342 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 THRSPQ92748 146 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 OR8B4Q96RC9 309 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 UCN2Q96RP3 112 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 EXO5Q9H790 373 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 GLTPQ9NZD2 209 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.6■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 A0A075B6Q4 140 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 A0A1W2PPL8 197 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 GPR171O14626 319 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RAMP1O60894 148 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CEACAM4O75871 244 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ARL6IP5O75915 188 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF432O94892 652 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 QDPRP09417 244 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 WT1P19544 449 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CLDN15P56746 228 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF846Q147U1 533 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 PCK2Q16822 640 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 LIPNQ5VXI9 398 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 TRILQ7L0X0 811 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 OR52N5Q8NH56 324 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 MCHR2Q969V1 340 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 KLK13Q9UKR3 277 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CEP250Q9BV73 2442 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 FREM3P0C091 2139 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CD8B2A6NJW9 211 aa16.59■□□□□ 0.25
MEG3-208ENST00000429159 CLDN25C9JDP6 229 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms