RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MUC15Q8N387 334 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 NABP1Q96AH0 204 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SIAEQ9HAT2 523 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPL8 197 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 OVOL3O00110 214 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 AHCYL1O43865 530 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MGRN1O60291 552 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 TXNDC12O95881 172 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GASTP01350 101 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 PAX1P15863 534 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ADAM8P78325 824 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 HGFACQ04756 655 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 Q5PR19 223 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 VHLLQ6RSH7 139 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SAMD8Q96LT4 415 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 IFT27Q9BW83 186 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 DSCAMO60469 2012 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GNGT2O14610 69 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ATP5J2P56134 94 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ETFDHQ16134 617 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MICAQ29983 383 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SHEQ5VZ18 495 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ADCK1Q86TW2 530 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 NUP37Q8NFH4 326 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SYT4Q9H2B2 425 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CA10Q9NS85 328 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 IMPA2O14732 288 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ARPC3O15145 178 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FKBP6O75344 327 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SERPINA5P05154 406 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CTLA4P16410 223 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 LAP3P28838 519 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GK3PQ14409 553 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FAM27BQ5VT28 67 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 RERGLQ9H628 205 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 YY1AP1Q9H869 796 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.61■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SLC16A7O60669 478 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF35P13682 527 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF32P17041 273 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 MSR1P21757 451 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 THBS4P35443 961 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CBX1P83916 185 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 DAG1Q14118 895 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 KRT80Q6KB66 452 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FBXO17Q96EF6 278 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CACNG6Q9BXT2 260 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 POLE4Q9NR33 117 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 SCG5P05408 212 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 CST2P09228 141 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 GSTM3P21266 225 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 NR4A1P22736 598 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-205ENST00000426683 NOS3P29474 1203 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms