RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF74Q16587 644 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 HBMQ6B0K9 141 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 SYT14Q8NB59 555 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 OR2V1Q8NHB1 315 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 TAAR8Q969N4 342 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 ITPKCQ96DU7 683 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 ADGRG7Q96K78 797 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 DDOQ99489 341 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 MPDZO75970 2070 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 SVILO95425 2214 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-204ENST00000409441 AHRRA9YTQ3 701 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SULT2B1O00204 365 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LRRTM2O43300 516 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 OR2T1O43869 369 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 AHSA1O95433 338 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 APOA1P02647 267 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TPOP07202 933 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CLUP10909 449 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 IMPDH2P12268 514 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 DIO1P49895 249 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SLC25A1P53007 311 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 HSF2Q03933 536 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TLE1Q04724 770 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SGCBQ16585 318 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 EMC4Q5J8M3 183 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 MZT2AQ6P582 158 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 XKRXQ6PP77 449 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SYS1Q8N2H4 156 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 OR4K13Q8NH42 304 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 OR10D3Q8NH80 312 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 MIB2Q96AX9 1013 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TBX5Q99593 518 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 NEURL2Q9BR09 285 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SRRQ9GZT4 340 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 RERGLQ9H628 205 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ABCB9Q9NP78 766 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 POLE4Q9NR33 117 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CHD6Q8TD26 2715 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CD8B2A6NJW9 211 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LIPT2A6NK58 231 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 PRRG2O14669 202 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CXCL13O43927 109 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SLC19A2O60779 497 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TXNDC12O95881 172 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CD1AP06126 327 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CD14P08571 375 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CD8BP10966 210 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 OR2B6P58173 313 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 RAC3P60763 192 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LTBQ06643 244 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 PON3Q15166 354 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 OR7A5Q15622 319 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 C4orf36Q96KX1 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 FKRPQ9H9S5 495 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TIGARQ9NQ88 270 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 NANSQ9NR45 359 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 LRRN3E7EW58 273 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 J3QLW9 94 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 PMS2P2O95744 297 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF19P17023 458 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 SPI1P17947 270 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 UQCRC1P31930 480 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMS1-204ENST00000409441 TGM4P49221 684 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms