RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 MLF1P58340 268 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GLO1Q04760 184 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SCN1BQ07699 218 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZP4Q12836 540 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SNTA1Q13424 505 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SSPNQ14714 243 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZS46 218 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TPRA1Q86W33 373 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RDH10Q8IZV5 341 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6S1Q8NH40 331 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB10Q8WXI3 467 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZPBPQ9BS86 351 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SP140LQ9H930 580 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0B4J203 849 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0G2JK05 382 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NIZ1 184 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF879B4DU55 563 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT2B1O00204 365 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PIN1P1O15428 100 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD1O60671 282 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ABHD16AO95870 558 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PTTG1O95997 202 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHMP01871 453 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD63P08962 238 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CSF3P09919 207 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 UCHL1P09936 223 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF806P0C7X5 589 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ICAM2P13598 275 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF823P16415 610 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SRMP19623 302 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP2K6P52564 334 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 BLVRAP53004 296 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DLX5P56178 289 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAP1BP61224 184 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAP1AP62834 184 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 Q0VFX4 171 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMK2DQ13557 499 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAET1LQ5VY80 246 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT77Q7Z794 578 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CADM3Q8N126 398 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N402 240 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FADS6Q8N9I5 356 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX19Q8NA77 164 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP6Q96JE9 813 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX18Q96RF0 628 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MNTQ99583 582 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PROK2Q9HC23 129 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NOTOA8MTQ0 251 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PHYHO14832 338 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC19A2O60779 497 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAMP1O60894 148 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM127O75204 238 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD1AP06126 327 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms