RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 JMJD7P0C870 316 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ATF1P18846 271 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CPT2P23786 658 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 EFNA3P52797 238 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 IL10RAQ13651 578 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGN3Q15651 99 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK11Q9UBX7 282 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF254O75437 659 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG12O94817 140 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP1B3P54709 279 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 GPNMBQ14956 572 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 OR1S1Q8NH92 325 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 TSSK2Q96PF2 358 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 H0Y8X5 98 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 METAP1P53582 386 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 NT5CQ8TCD5 201 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 UPRTQ96BW1 309 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB13Q8WXK3 278 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RSC1A1Q92681 617 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 LY75O60449 1722 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF749O43361 778 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF4O60810 478 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 P2RX1P51575 399 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 AGBL4Q5VU57 503 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 POMT2Q9UKY4 750 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CCSO14618 274 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 FFAR1O14842 300 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 WDPCPO95876 746 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 PMP2P02689 132 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 FCGR2AP12318 317 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 CD1CP29017 333 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 AANATQ16613 207 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 COL4A5P29400 1685 aa14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 BPNT1O95861 308 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 IL5P05113 134 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 NME2P22392 152 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 ACKR1Q16570 336 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 OPN5Q6U736 354 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 AMER3Q8N944 861 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 CTHP32929 405 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 PPICP45877 212 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 MTCP1P56278 107 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 INSL4Q14641 139 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00303Q3SY05 128 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5H14A6NHG9 310 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 ADRB1P08588 477 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2-201ENST00000398073 GABREP78334 506 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms