RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SYT9Q86SS6 491 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ADCK1Q86TW2 530 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 DHFR2Q86XF0 187 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF519Q8TB69 540 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CDH20Q9HBT6 801 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NOX3Q9HBY0 568 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.36□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFHX3Q15911 3703 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS37A4D1T9 235 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM64BA6NI03 449 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC42EP2O14613 210 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 IMPA2O14732 288 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SYNGR3O43761 229 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TXNDC12O95881 172 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CELA3BP08861 270 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MSR1P21757 451 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBG1P23258 451 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FPR3P25089 353 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SDHAP31040 664 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RRM2P31350 389 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 APLNRP35414 380 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR4P46093 362 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 OMPP47874 163 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LIMS1P48059 325 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PDLIM4P50479 330 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS6KA3P51812 740 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ERVK-25P63136 954 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MYBPC1Q00872 1141 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SPIBQ01892 262 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 HSF2Q03933 536 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB39AQ14964 217 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SGCAQ16586 387 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LCN8Q6JVE9 175 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL9Q6T311 187 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM168AQ92567 244 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF570Q96NI8 536 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX18Q96RF0 628 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 DOK1Q99704 481 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SH3GL3Q99963 347 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FUZQ9BT04 418 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM15Q9C019 465 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF223E7ERA6 249 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC3O15145 178 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10H3O60404 316 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NDUFS7O75251 213 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC2A10O95528 541 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LY6G6DO95868 133 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 COX5BP10606 129 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CRABP1P29762 137 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC6A6P31641 620 aa7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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