RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9orf106Q8NAJ2 232 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10H4Q8NGA5 316 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6K6Q8NGW6 343 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 WNT2BQ93097 391 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM45BQ96B21 275 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBP7Q96R05 134 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL7BQ9BQE9 202 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 FKBP7Q9Y680 259 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM64BA6NI03 449 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 EDN3P14138 238 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD79BP40259 229 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GGTLC2Q14390 218 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHYHD1Q5SRE7 291 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYPD4Q6UWN0 246 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL36Q8N4N3 616 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6N1Q8NGY5 312 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPT1CQ8TCG5 803 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GATAD2BQ8WXI9 593 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXN4Q96NZ1 517 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBX5Q99593 518 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED12LQ86YW9 2145 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 FIGNL2A6NMB9 653 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCRL2O00421 344 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 EDNRAP25101 427 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSNK1A1P48729 337 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 THEM4Q5T1C6 240 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3P1Q6ZMU1 363 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM54Q969K7 222 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCHR2Q969V1 340 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLTPQ9NZD2 209 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM215AQ9Y5M1 114 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 DAPL1A0PJW8 107 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD8B2A6NJW9 211 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLCEO94923 617 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPANK1O95872 356 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRABP1P29762 137 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP6Q13520 282 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.526e-8■■■■□ 19.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCNT2Q8N0V5 402 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSMAFQ92636 917 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 INPP5EQ9NRR6 644 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOKQ9UQ07 419 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPW3 197 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CENPBD1B2RD01 187 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRRG2O14669 202 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC19A2O60779 497 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC43A1O75387 559 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 QDPRP09417 244 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GADD45AP24522 165 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGTR1P30556 359 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM3P62310 102 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSX1Q16384 188 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRFN4Q6PJG9 635 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEM1Q6ZVN7 128 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 C20orf196Q8IYI0 205 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF485Q8NCK3 441 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 GP6Q9HCN6 339 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGER4P35408 488 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 CENPAP49450 140 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF511Q8NB15 262 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52N1Q8NH53 320 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALG8Q9BVK2 526 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARPBPQ9NWS1 579 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10-202ENST00000380221 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 UPK3AO75631 287 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNM1P34Q6PK57 102 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLRX2Q9NS18 164 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 AIREO43918 545 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV3-9P01782 118 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTC1P68032 377 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTA1P68133 377 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 GALEQ14376 348 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPCS2Q15005 226 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATCAYQ86WG3 371 aa24.5■■□□□ 1.51
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