RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 UPK3AO75631 287 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GPANK1O95872 356 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CRHP06850 196 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NPR2P20594 1047 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MSR1P21757 451 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TIMP3P35625 211 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ENTPD1P49961 510 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ACTA2P62736 377 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ACTG2P63267 376 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FAPQ12884 760 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MED22Q15528 200 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NEDD8Q15843 81 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SGCAQ16586 387 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM16Q2WEN9 425 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LHFPL3Q86UP9 236 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 THEM6Q8WUY1 208 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SNX33Q8WV41 574 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SGCDQ92629 289 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NELFAQ9H3P2 528 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 WDR76Q9H967 626 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CRLF2Q9HC73 371 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GPR35Q9HC97 309 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KCNG2Q9UJ96 466 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PROCRQ9UNN8 238 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ACACAQ13085 2346 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-9P01782 118 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 IGHA1P01876 353 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HRGP04196 525 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM18P0DKX4 95 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 OR3A2P47893 321 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NR1H2P55055 460 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 STK11Q15831 433 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C3P1Q6ZMU1 363 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DOLPP1Q86YN1 238 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TIGD4Q8IY51 512 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC26A10Q8NG04 563 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf40Q8WZ69 217 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RORBQ92753 470 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FOXB1Q99853 325 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ALG8Q9BVK2 526 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MARCH7Q9H992 704 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 TINAGQ9UJW2 476 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HSPB2A8KAH6 182 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MPZL1O95297 269 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HTR1AP08908 422 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GAAP10253 952 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CTSSP25774 331 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PSMB9P28065 219 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CDAP32320 146 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 NTF4P34130 210 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MAP2K4P45985 399 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ETV1P50549 477 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 GALEQ14376 348 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 HSPB2Q16082 182 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 MEP1BQ16820 701 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RNLSQ5VYX0 342 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 RTL6Q6ICC9 239 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 PCSK4Q6UW60 755 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 CDC20BQ86Y33 519 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ASB17Q8WXJ9 295 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 JAM3Q9BX67 310 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-201ENST00000368202 POLE4Q9NR33 117 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms