RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352127.11

XRCC3-201, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC3, Length 2,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-201ENST00000352127 FMODQ06828 376 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF626Q68DY1 528 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 OR8B4Q96RC9 309 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 ETV7Q9Y603 341 aa15.96■□□□□ 0.15
XRCC3-201ENST00000352127 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 PRSS37A4D1T9 235 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 POM121CA8CG34 1229 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CD3DP04234 171 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 GTF2F2P13984 249 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 IFNGR1P15260 489 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ABCD3P28288 659 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 H2BFSP57053 126 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 EGR3Q06889 387 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CDH24Q86UP0 819 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TTC9Q92623 222 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SFXN2Q96NB2 322 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 H3BMH7 237 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 H7C417 338 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 IFNA7P01567 189 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 PDGFAP04085 211 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 FOLR1P15328 257 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 EMC4Q5J8M3 183 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 GKN2Q86XP6 184 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ADGRG3Q86Y34 549 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MSANTD3Q96H12 275 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MED30Q96HR3 178 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 FITM1A5D6W6 292 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 LILRA5A6NI73 299 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 GP1BBP13224 206 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ARPC5O15511 151 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TSPAN2O60636 221 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 RAB30Q15771 203 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 KRT77Q7Z794 578 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CTSFQ9UBX1 484 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 A0A1W2PR77 199 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 PLSCR5A0PG75 271 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 OR2M5A3KFT3 312 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF35P13682 527 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ARL4DP49703 201 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ABHD6Q9BV23 337 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 FRYLO94915 3013 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 L7N2F9 121 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 IGF2P01344 180 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SPOCK1Q08629 439 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CORO6Q6QEF8 472 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 EID2Q8N6I1 236 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF519Q8TB69 540 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 STK35Q8TDR2 534 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-201ENST00000352127 CA14Q9ULX7 337 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms