RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF823P16415 610 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 CEP78Q5JTW2 689 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 CARD17Q5XLA6 110 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 XKRXQ6PP77 449 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 RBP7Q96R05 134 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MALT1Q9UDY8 824 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PINLYPA6NC86 204 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PRR33A8MZF0 331 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KIR3DL2P43630 455 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CD97P48960 835 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 EVX1P49640 407 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CLRN1P58418 232 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ODF4Q2M2E3 257 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SPINK14Q6IE38 97 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KRT77Q7Z794 578 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 RDH10Q8IZV5 341 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 NKD1Q969G9 470 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SEC14L5O43304 696 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TMCC2O75069 709 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF17P17021 662 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF43P17038 809 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ELK1P19419 428 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SRD5A2P31213 254 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CD96P40200 585 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 DCAF10Q5QP82 559 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRILQ7L0X0 811 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 DERL3Q96Q80 235 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SOSTQ9BQB4 213 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PIGQQ9BRB3 760 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 MED13Q9UHV7 2174 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 A0A0J9YW62 118 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 H3BSH0 61 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PGA4P0DJD7 388 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PGA3P0DJD8 388 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SPNP16150 400 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SRMP19623 302 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 RAC1P63000 192 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 H3F3AP84243 136 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ROM1Q03395 351 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PYDC2Q56P42 97 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 WDR38Q5JTN6 314 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PRSS33Q8NF86 280 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR14L1PQ8NHC6 308 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PHYHIPQ92561 330 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LRFN1Q9P244 771 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HSPB2A8KAH6 182 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM25AB3EWG3 89 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM25CB3EWG5 89 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 FAM25GB3EWG6 89 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 H0YC42 278 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF11O14788 317 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SLC19A2O60779 497 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LRP3O75074 770 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PAHP00439 452 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PNPP00491 289 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 IGHG1P01857 330 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CNR1P21554 472 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ITGA3P26006 1051 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SOX2P48431 317 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GABREP78334 506 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HSPB2Q16082 182 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 THEM4Q5T1C6 240 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR7E24Q6IFN5 339 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CORO6Q6QEF8 472 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR52N5Q8NH56 324 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms