RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SLC17A1Q14916 467 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MZT2AQ6P582 158 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 POC5Q8NA72 575 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PIGQQ9BRB3 760 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TIGARQ9NQ88 270 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LRFN1Q9P244 771 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RASD1Q9Y272 281 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PINLYPA6NC86 204 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SEC14L5O43304 696 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LRP3O75074 770 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF823P16415 610 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SRD5A2P31213 254 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CD97P48960 835 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 H3F3AP84243 136 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 BAK1Q16611 211 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CARD17Q5XLA6 110 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CNIH2Q6PI25 160 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RBP7Q96R05 134 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 H0YC42 278 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PFDN1O60925 122 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PGA4P0DJD7 388 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PGA3P0DJD8 388 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA3P26006 1051 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CD96P40200 585 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CLRN1P58418 232 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 GABREP78334 506 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ODF4Q2M2E3 257 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CEP78Q5JTW2 689 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TRILQ7L0X0 811 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KRT77Q7Z794 578 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00346Q8IVM7 164 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RAC1P63000 192 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ROM1Q03395 351 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RDH10Q8IZV5 341 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MALT1Q9UDY8 824 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0J9YW62 118 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TNFSF11O14788 317 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 IGHG1P01857 330 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TGIF1Q15583 401 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR52N5Q8NH56 324 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 DERL3Q96Q80 235 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 FREM3P0C091 2139 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 HSPB2A8KAH6 182 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 H3BSH0 61 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PAHP00439 452 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SRMP19623 302 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KIR3DL2P43630 455 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 EVX1P49640 407 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 HSPB2Q16082 182 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 WDR38Q5JTN6 314 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 THEM4Q5T1C6 240 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 XKRXQ6PP77 449 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR6X1Q8NH79 312 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PHYHIPQ92561 330 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf45Q96LM5 186 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 UCN2Q96RP3 112 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TMCC2O75069 709 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 NEURL1O76050 574 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PNPP00491 289 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SOX2P48431 317 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MFAP5Q13361 173 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PCK2Q16822 640 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CORO6Q6QEF8 472 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RNF128Q8TEB7 428 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LRP12Q9Y561 859 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ELK1P19419 428 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms