RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OTOSQ8NHW6 89 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGEF1-201ENST00000284957 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SIAEQ9HAT2 523 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF716A6NP11 495 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF432O94892 652 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPZA2P47755 286 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TGM4P49221 684 aa8.3□□□□□ -1.08
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