RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00471Q8N535 108 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 RTN4RQ9BZR6 473 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ASPMQ8IZT6 3477 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 MCRIP1C9JLW8 97 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ITGA10O75578 1167 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 CSTAP01040 98 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 THBS2P35442 1172 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 MTNR1BP49286 362 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 MEOX2P50222 304 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL36Q8N4N3 616 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ASB6Q9NWX5 421 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GLAP06280 429 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R41P59536 307 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 POGLUT1Q8NBL1 392 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MCHR1Q99705 422 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP13Q12802 2813 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NGFRP08138 427 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 HTR2AP28223 471 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 VEGFCP49767 419 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ERVK-25P63136 954 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FGL1Q08830 312 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FAM27D1Q5T7N8 215 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SFXN4Q6P4A7 337 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FAM71CQ8NEG0 241 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CA10Q9NS85 328 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PIPOXQ9P0Z9 390 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MPTX1A8MV57 137 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINA7P05543 415 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO45P0C2W1 286 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ADH7P40394 386 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 DHODHQ02127 395 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR10A4Q9H209 315 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 IL20RAQ9UHF4 553 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00587B1AMM8 73 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ARPC5O15511 151 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OIP5O43482 229 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SUSD5O60279 629 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FADS1O60427 444 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 S100A11P31949 105 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1E1P36543 226 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CHAF1BQ13112 559 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MARCH3Q86UD3 253 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ARMC10Q8N2F6 343 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 BBS1Q8NFJ9 593 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SPTBN2O15020 2390 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf51A8MQB3 221 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ALG1L2C9J202 215 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF10Q5QP82 559 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GRHL3Q8TE85 626 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 IP6K3Q96PC2 410 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ARL6Q9H0F7 186 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 WASF3Q9UPY6 502 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQD3 144 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR6C65A6NJZ3 312 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RNF13O43567 381 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR5F1O95221 314 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FOSL1P15407 271 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MLF1P58340 268 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CLN3Q13286 438 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SKP2Q13309 424 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A10Q63ZE4 541 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR4Q3Q8NH05 313 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV20A0A0B4J274 112 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM10O14672 748 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 THY1P04216 161 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PTNP21246 168 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 HAAOP46952 286 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN31Q12999 210 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CBLN3Q6UW01 205 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms