RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 MED18Q9BUE0 208 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ACOT7O00154 380 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD16AO95870 558 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 IL1AP01583 271 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF823P16415 610 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SOX6P35712 828 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LHX2P50458 406 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 FOXC1Q12948 553 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC10A1Q14973 349 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 BCL2A1Q16548 175 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF404Q494X3 552 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SMIM19Q96E16 107 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MMP27Q9H306 513 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.94□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KLK10O43240 276 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 UPK3AO75631 287 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 AQP8O94778 261 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PSKH1P11801 424 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LAP3P28838 519 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC3A1Q07837 685 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MCFD2Q8NI22 146 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GHSRQ92847 366 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MCHR2Q969V1 340 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.93□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PSMD9O00233 223 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NCKAP5O14513 1909 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SPTBN2O15020 2390 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GPRIN2O60269 458 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SC5DO75845 299 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MPZL1O95297 269 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ACTL6AO96019 429 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SPARCP09486 303 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 INHBBP09529 407 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF708P17019 499 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 EDNRAP25101 427 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CLDN18P56856 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ROM1Q03395 351 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MEP1BQ16820 701 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LIPNQ5VXI9 398 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CARD17Q5XLA6 110 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TRILQ7L0X0 811 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM123Q8N131 208 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD4Q8TB40 342 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 NSMAFQ92636 917 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM54Q969K7 222 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR2M2Q96R28 347 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR8B4Q96RC9 309 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GALNT8Q9NY28 637 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 GLTPQ9NZD2 209 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CD8B2A6NJW9 211 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF716A6NP11 495 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 TMCC2O75069 709 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF432O94892 652 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CDRT1O95170 752 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 SERPINA3P01011 423 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 QDPRP09417 244 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CD8BP10966 210 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 PSMB10P40306 273 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 CSNK1A1P48729 337 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 RORCP51449 518 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 MEIOBQ8N635 442 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.92□□□□□ -0.02
TVP23C-201ENST00000225576 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms