RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RHCG	Q9UBD6	479 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ZAN	Q9Y493	2812 aa		8.1	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479		J3KTA2	159 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R233	179 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NME4	O00746	187 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	PIP5K1C	O60331	668 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SERPINA1	P01009	418 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNA2	P01563	188 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NR2C1	P13056	603 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	MAK	P20794	623 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RAD52	P43351	418 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	GSK3B	P49841	420 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT2	P50583	147 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SELENOV	P59797	346 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	CTXN1	P60606	82 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKCD	Q05655	676 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	CD47	Q08722	323 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SGCA	Q16586	387 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	FXN	Q16595	210 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	MSMP	Q1L6U9	139 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf128	Q5T292	105 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RRM2B	Q7LG56	351 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	OAF	Q86UD1	273 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NRM	Q8IXM6	262 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF786	Q8N393	782 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51A7	Q8NH64	312 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	NSMAF	Q92636	917 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM162A	Q96A26	154 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	RBP7	Q96R05	134 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT3	Q9BQG1	590 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	BEX2	Q9BXY8	128 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	TPK1	Q9H3S4	243 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SIAE	Q9HAT2	523 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH20	Q9HBT6	801 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	DUSP13	Q9UII6	198 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	FZR1	Q9UM11	496 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	PLCE1	Q9P212	2302 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		8.09	□□□□□ -1.11
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WUU8	490 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	GMNC	A6NCL1	334 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	FFAR1	O14842	300 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	LMX1B	O60663	402 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	GMNN	O75496	209 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A10	O95528	541 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	LCK	P06239	509 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM157B	P0CG42	384 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL2	P13500	99 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	NCK1	P16333	377 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF23	P17027	643 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	FUT4	P22083	530 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	GIF	P27352	417 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	CDA	P32320	146 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	APLNR	P35414	380 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	ALDH3B1	P43353	468 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC24C	P53992	1094 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	UCP2	P55851	309 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	PSME3	P61289	254 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	CBX1	P83916	185 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	HSF2	Q03933	536 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	THEM4	Q5T1C6	240 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	GLYAT	Q6IB77	296 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		8.08	□□□□□ -1.12
KIFC3-231	ENST00000567479	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		8.08	□□□□□ -1.12

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