RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558190.5

ATXN3-248, Transcript of ataxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 26,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-248ENST00000558190 TNCP24821 2201 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 MYO10Q9HD67 2058 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 A0A1W2PPH5 198 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CLDN1O95832 211 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ADRA2CP18825 462 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 FZD2Q14332 565 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TTC32Q5I0X7 151 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 MARCH3Q86UD3 253 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TMEM99Q8N816 258 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TARM1B6A8C7 271 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CTSAP10619 480 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 VHLLQ6RSH7 139 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 R3HDM4Q96D70 268 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OPALINQ96PE5 141 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 EHFQ9NZC4 300 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GPR31O00270 319 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 P2RY10O00398 339 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SIGLEC5O15389 551 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GP1BAP07359 652 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 LCN6P62502 163 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PLP2Q04941 152 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ERV3-1Q14264 604 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF74Q16587 644 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 DHRS13Q6UX07 377 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ASB13Q8WXK3 278 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TSLPQ969D9 159 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 KCNK6Q9Y257 313 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR10A2Q9H208 303 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GPR160Q9UJ42 338 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 NAGAP17050 411 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GAB1Q13480 694 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR4A47Q6IF82 309 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GMLQ99445 158 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GABARAPH6UMI1 98 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 GPR75O95800 540 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 QDPRP09417 244 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 IL1RNP18510 177 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PCMT1P22061 227 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TLE1Q04724 770 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF542PQ5EBM4 170 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 LYG2Q86SG7 212 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 NUDT13Q86X67 352 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR5M9Q8NGP3 310 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ABCD4O14678 606 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 HS3ST1O14792 307 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TRGC2P03986 189 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PTHLHP12272 177 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PRPS1P60891 318 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 SDC1P18827 310 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZNF154Q13106 437 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR7C2O60412 319 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 IQCF3P0C7M6 154 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ATP1B3P54709 279 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CITED1Q99966 193 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 TEX101Q9BY14 249 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 CD109Q6YHK3 1445 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 LRP5LA4QPB2 252 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-248ENST00000558190 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms